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三甲医院是中国内地对医院实行“三级六等”的划分等级中的最高级别。据卫计委网站公开数据显示，截止2016年5月3日，北京市共有30家三级甲等医院，包括北京博爱医院、北京大学第六医院、北京大学第三医院等。北京三甲医院名单详情如下：
| 北京三甲医院名单 | ||
| 医院名称 | 医院类别 | 亿元等级 |
| 北京博爱医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 北京大学第六医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 北京大学第三医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 北京大学第一医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 北京大学口轻医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 北京大学人民医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 北京回龙观医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 北京积水潭医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 北京肿瘤医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都儿科研究所附属儿童医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京安贞医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京安定医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京朝阳医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京地坛医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京儿童医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京妇产医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京口腔医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京世纪坛医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京天坛医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京同仁医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京胸科医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京佑安医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学附属北京友谊医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 首都医科大学宣武医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 卫生部北京医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 卫生部中日友好医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 中国医学科学院北京协和医院 | 综合医院 | 三级甲等 |
| 中国医学院整形外科医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 中国医学科学院阜外心血管病医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
| 中国医学科学院肿瘤医院 | 专科医院 | 三级甲等 |
三级医院：(病床数在501张以上)是向几个地区提供高水平专科性医疗卫生服务和执行高等教育、科研任务的区域性以上的医院。甲等：按千分制，分等评分标准获得超过900分为甲等。此外，三甲医院申报考核的主要项目包括医疗服务与管理、医疗质量与安全、技术水平与效率。内地民营医院也可以参与医疗等级评定。
